和赵志得出的结论一样，日本方面也是对美国的海军很感兴趣，在他们看来，高傲的美国佬也就是仗着他们的那些军舰才为所欲为，只要能打掉他们为之依仗的海军，大日本帝国在亚洲可真就是所向无敌的了。“按照美军太平洋舰队目前的航向来看，我们从美国获得的那份情报是真的，太平洋舰队的确是去珍珠港休整的”结合大本营获得的一系列情报，参谋部最后得出了结论。
大家的目光都落在了一言不发的联合舰队指挥官山本五十六的身上，这个一直鼓吹偷袭珍珠港利国论的人自打进了会议室就一言不发，所有的人都不知道是为了什么。其实山本五十六是沉浸在被自己推演了无数遍的行动顺序里，美军太平洋舰队休整的珍珠港位于日、美之间太平洋东部的夏威夷群岛，距日本约3500多海里，距美国本土约2000海里，是美国太平洋舰队最重要的基地。
1941年1月7日，山本五十六就曾经写信给海军大臣及川古志郎，正式提出了偷袭珍珠港的设想：我军在日美战争首先应该采取的策略应该是：一开战就猛击击破敌主力舰队，置美国海军及美国国民于无可挽救之地，使其士气沮丧。从而才能占据东亚之要障，确保不败之地步，以此来建设东亚共荣圈，……，一旦击破美主力舰队，菲律宾以南的闲杂兵力必然士气沮丧，很难考虑能勇敢战斗。
此后三本五十六就和手下的几个参谋（大西泷治郎、源田实、黑岛龟人）一起，秘密地制定偷袭珍珠港的作战方案。6月，正式方案提出后，曾在日本上层引起争论，一些人不相信庞大的舰队横渡3500海里而不被发现，对这一计划的可行性表示怀疑。万一不成功怎么办？失败的可能性比成功的可能性要大得多，该如何处理？
山本五十六的回答非常简单，也很山本五十六：如果日本有天佑，夏威夷作战肯定成功，如果中途失败，也就是说没有了天佑这一条，放弃整个作战就行了。山本固执己见，甚至以辞职相要挟。军令部总长永野修身大将说：如果山本有这么样的自信就照他说的去做吧。于10月中旬批准了这个计划。于是，山本指挥联合舰队选择了与珍珠港相似的鹿儿岛湾，开始了充分的准备和严格的模拟训练
后来这个攻击计划被有心人上报给了裕仁天皇，正是担心舰队的隐蔽问题，这个攻击计划最后还是被搁置了起来，从山本五十六开始制定这个计划开始，到现在已经差不多过去一个年头了，野心勃勃的山本五十六看着自己的计划能够得以实施，焉能不兴奋。
“海军已经准备好了，随时可以展开行动”山本五十六现在所考虑的不单单是藏进珍珠港里休整的太平洋舰队，还有驻守菲律宾境内的美军第五航空飞行队。德军在英吉利海峡和英法海军交战的时候，就曾经出现过被英国战机的直投鱼雷击沉巡洋舰的事情，山本五十六不希望被自己置若性命的军舰毁在美军第五航空飞行队的手里。
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